Po opravljeni diplomi na Veterinarski fakulteti Univerze v Ljubljani je Marko Pipan nadaljeval s kliničnim podiplomskim izobraževanjem na Univerzi v Ljubljani, Univerzi v Utrechtu in Univerzi v Pensilvaniji. Po končani 3-letni specializaciji iz urgentne in intenzivne medicine malih živali v Ameriki in opravljenem mednarodnem specialističnem izpitu je leta 2011 pridobil naziv Diplomata Ameriškega kolegija za urgentno in intenzivno medicino (Dipl. ACVECC). S tem je postal eden prvih mednarodno priznanih specialistov iz klinične veterine malih živali v Sloveniji.
V zadnjih letih Marko aktivno predava o urgentni in intenzivni medicini psov in muc v Sloveniji in tujini. Kot specialist svojega področja veterinarske medicine, je služboval in svetoval v Angliji, Maleziji, Nemčiji in Avstriji. Leta 2016 je v sodelovanju z Evropskim veterinarskim združenjem za urgentno in intenzivno medicino kot predsednik lokalnega organizacijskega odbora organiziral letni kongres združenja v Ljubljani.
Marko je že dolgoleten sodelavec Bolnice za živali Postojna. Njegov glavni interes so travmatizirani pacienti, respiratorne motnje, šokovna stanja vseh etiologij, intoksikacije, akutne nevrološke motnje in ostala kritična stanja. Poleg naštetega, sodeluje tudi pri anesteziji živali in slikovni diagnostiki (tj. ultrazvočne preiskave, rentgensko slikanje, CT), pri čemer v zadnjem času veliko pozornosti posveča računalniški tomografiji. Redna letna izobraževanja na specialističnih ustanovah v tujini mu omogočajo vzdrževanje ustrezne ravni strokovnega znanja in pristen stik s tujimi strokovnjaki veterinarske medicine.
